Народився у 1947 році в Києві, де нині живе й працює. 

Навчався в Республіканській художній середній школі імені Т. Г. Шевченка (нині Державна художня середня школа ім. Т. Г. Шевченка) у Києві у 1958—1965 роках. Також навчався у Київському державному художньому інституті (нині Національна академія образотворчого мистецтва та архітектури), у майстерні монументального живопису у 1965—1971 роках під керівництвом Тетяни Яблонської. Згодом викладав у Київському державному художньому інституті (нині Національна академія образотворчого мистецтва й архітектури) протягом 1972—2023 років. З 1975 — член Національної спілки художників. 1992 року отримав звання Заслуженого діяча мистецтв України. 

Практика Володимира Буднікова заснована на дослідженні меж живопису і графіки, абстракції й фігуративу, де різноманітні та, на перший погляд, антагоністичні властивості матеріалу та форм, виразно поєднуються в єдине ціле. З початком повномасштабного вторгнення, художник працює над графічною й дещо щоденниковою серією «Час війни» як реакцією на воєнні події.